Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR3Q03167 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TGFBR3Q03167 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms