Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A11Q02978 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC25A11Q02978 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms