Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ARF1P84077 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARF1P84077 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF1P84077 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF1P84077 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF1P84077 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF1P84077 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms