Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX1P83916 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX1P83916 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CBX1P83916 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CBX1P83916 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CBX1P83916 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CBX1P83916 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms