Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVK-16P61578 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVK-16P61578 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms