Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FBXW4P57775 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FBXW4P57775 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FBXW4P57775 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FBXW4P57775 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXW4P57775 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXW4P57775 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXW4P57775 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FBXW4P57775 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms