Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT8P50990 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT8P50990 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT8P50990 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT8P50990 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT8P50990 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8P50990 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8P50990 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCT8P50990 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms