Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRP3P50461 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms