Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP4P49662 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP4P49662 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP4P49662 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP4P49662 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP4P49662 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP4P49662 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP4P49662 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP4P49662 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP4P49662 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms