Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITPNBP48739 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITPNBP48739 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms