Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A1P43005 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A1P43005 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A1P43005 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms