Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSKP41240 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSKP41240 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSKP41240 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSKP41240 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSKP41240 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSKP41240 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSKP41240 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSKP41240 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSKP41240 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSKP41240 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSKP41240 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSKP41240 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSKP41240 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSKP41240 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSKP41240 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSKP41240 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSKP41240 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSKP41240 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms