Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V1E1P36543 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms