Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCD1P33897 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms