Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DSG3P32926 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DSG3P32926 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DSG3P32926 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DSG3P32926 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DSG3P32926 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DSG3P32926 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DSG3P32926 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms