Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID4AP29374 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ARID4AP29374 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARID4AP29374 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms