Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD9P28356 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD9P28356 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms