Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ME2P23368 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME2P23368 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ME2P23368 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ME2P23368 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ME2P23368 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ME2P23368 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ME2P23368 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME2P23368 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME2P23368 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME2P23368 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME2P23368 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME2P23368 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME2P23368 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME2P23368 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ME2P23368 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME2P23368 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms