Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH1P12830 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH1P12830 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH1P12830 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH1P12830 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH1P12830 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH1P12830 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH1P12830 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH1P12830 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH1P12830 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH1P12830 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH1P12830 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH1P12830 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH1P12830 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH1P12830 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms