Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VDRP11473 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VDRP11473 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VDRP11473 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VDRP11473 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VDRP11473 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VDRP11473 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VDRP11473 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VDRP11473 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VDRP11473 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VDRP11473 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms