Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THRAP10827 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THRAP10827 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THRAP10827 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THRAP10827 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP10827 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP10827 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP10827 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THRAP10827 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THRAP10827 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THRAP10827 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THRAP10827 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THRAP10827 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THRAP10827 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms