Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBBP0CG47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBBP0CG47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms