Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGA5P08648 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ITGA5P08648 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms