Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDHA1P08559 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDHA1P08559 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms