Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPIND1P05546 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPIND1P05546 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPIND1P05546 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPIND1P05546 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPIND1P05546 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms