Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P00740 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P00740 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P00740 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P00740 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P00740 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P00740 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P00740 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F9P00740 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
F9P00740 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F9P00740 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P00740 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F9P00740 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P00740 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P00740 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P00740 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms