Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NIPSNAP2O75323 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NIPSNAP2O75323 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms