Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN6O43657 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms