Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP2O00295 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP2O00295 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP2O00295 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TULP2O00295 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TULP2O00295 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TULP2O00295 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TULP2O00295 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms