Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFKBIEO00221 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFKBIEO00221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms