Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPK3BL1B0FP48 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPK3BL1B0FP48 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.2 ms