Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC13A5PLN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC13A5PLN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms