Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SSPOA2VEC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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