Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SPOCK3Q9BQ16 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms