Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKOR2Q2VWA4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms