Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms