Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SFT2D1Q8WV19 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms