Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ERVK-16P61578 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms