Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HSD3B2-201ENST00000369416 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ERVV-2-201ENST00000601417 2431 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC10-206ENST00000441969 2768 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM81A-201ENST00000288228 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MRVI1-215ENST00000541483 2468 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC149-202ENST00000389609 2127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC239800.2-201ENST00000443018 2675 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC067863.2-201ENST00000559120 1980 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC81-202ENST00000445632 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL031733.2-201ENST00000451992 2523 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms