Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC005154.1-204ENST00000580902 926 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms