Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NICN1Q9BSH3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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