Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ADIPOR1P2-201ENST00000554199 820 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CCDC103-203ENST00000410027 571 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
USP34Q70CQ2 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms