Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms