Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC2Q8TF65 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms