Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXD4L6Q3SYB3 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms