Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF18Q9Y5U5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TNFRSF18Q9Y5U5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms