Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFE2L3Q9Y4A8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFE2L3Q9Y4A8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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