Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHTOPQ9Y3Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms