Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC2Q9Y235 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms