Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHOC2Q9UQ13 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHOC2Q9UQ13 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHOC2Q9UQ13 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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